Οι συμπιεστές υδρογόνου μπορούν να ταξινομηθούν σε δύο τύπους με βάση την αρχή λειτουργίας τους: θετική μετατόπιση και δυναμική, με τη θετική μετατόπιση να είναι η πιο κοινή. Οι συμπιεστές θετικής μετατόπισης χωρίζονται περαιτέρω σε συμπιεστές παλινδρομικού εμβόλου και σε περιστροφικούς συμπιεστές. 1. Οι συμπιεστές με παλινδρομικό έμβολο αλλάζουν τον όγκο εργασίας του αερίου με την παλινδρομική κίνηση ενός εμβόλου μέσα σε έναν κύλινδρο. Οι εμβολοφόροι συμπιεστές έχουν μακρά ιστορία και ώριμη τεχνολογία παραγωγής. 2. Οι περιστροφικοί συμπιεστές περιλαμβάνουν περιστροφικούς συμπιεστές με πτερύγια (συρόμενα πτερύγια) και κοχλιωτούς συμπιεστές. Τα περισσότερα κλιματιστικά εγχώριας παραγωγής χρησιμοποιούν περιστροφικούς συμπιεστές. Οι κοχλιοφόροι συμπιεστές χρησιμοποιούνται κυρίως σε μεγάλους ψυκτικούς εξοπλισμούς και επίσης χρησιμοποιούνται ευρέως σε μεγάλα εμπορικά κέντρα και κτίρια γραφείων.
Όπως και άλλα αέρια, το υδρογόνο μπορεί να τεθεί υπό πίεση χρησιμοποιώντας παλινδρομικούς ή φυγοκεντρικούς συμπιεστές για την κάλυψη των απαιτήσεων της διαδικασίας. Σε κάθε τυπική εφαρμογή, ο τύπος του συμπιεστή θα πρέπει να προσδιορίζεται με βάση τον ρυθμό ροής του υδρογόνου και την απαιτούμενη πίεση. Για μεγάλες και μεσαίου μεγέθους μονάδες υδρογονοπυρόλυσης, παλινδρομικοί συμπιεστές χρησιμοποιούνται για νέο υδρογόνο, ενώ φυγόκεντροι συμπιεστές για κυκλοφορία υδρογόνου.